Sebagaimana juga yang hampir sama diungkapkan oleh Kaho
(2003), bahwa disamping memiliki beberapa keuntungan,
desentralisasi juga mengandung kelemahan-kelemahan, antara lain:
a. Karena besarnya organ-organ pemerintahan, maka struktur
pemerintahan bertambah kompleks yang mempersulit koordinasi.
b. Keseimbangan dan keserasian antara bermacam-macam
kepentingan dan daerah dapat lebih mucah terganggu.
c. Khusus mengenai desentralisasi territorial, dapat mendorong
timbulnya apa yang disebut daerahisme atau propinsialisme.
d. Keuntungan yang diambil memerlukan waktu yang lama, karena
memerlkukan perundingan yang bertele-tele.
e. Dalam penyelenggaraan desentralisasi, diperlukan biaya yang lebih
banyak dan sulit untuk memperoleh keseragaman dan
kesederhanaan.
